MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 93653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015554	AAT	2	6	160512	160517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891620
3002	NC_015554	TG	3	6	160605	160610	0 %	50 %	50 %	0 %	333891620
3003	NC_015554	CAA	2	6	160627	160632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891620
3004	NC_015554	TAA	2	6	160636	160641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891620
3005	NC_015554	GTG	2	6	160644	160649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891620
3006	NC_015554	ATG	2	6	160672	160677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891620
3007	NC_015554	T	6	6	160808	160813	0 %	100 %	0 %	0 %	333891620
3008	NC_015554	AAGA	2	8	160814	160821	75 %	0 %	25 %	0 %	333891620
3009	NC_015554	GAT	2	6	160885	160890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891620
3010	NC_015554	ATCT	2	8	160909	160916	25 %	50 %	0 %	25 %	333891620
3011	NC_015554	CAAG	2	8	161003	161010	50 %	0 %	25 %	25 %	333891620
3012	NC_015554	GAT	2	6	161081	161086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891620
3013	NC_015554	AAC	2	6	161132	161137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891620
3014	NC_015554	CTT	2	6	161252	161257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891621
3015	NC_015554	GTC	2	6	161266	161271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891621
3016	NC_015554	CGC	2	6	161385	161390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333891621
3017	NC_015554	CGC	2	6	161460	161465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333891621
3018	NC_015554	TTC	2	6	161630	161635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891621
3019	NC_015554	AAGA	2	8	161639	161646	75 %	0 %	25 %	0 %	333891621
3020	NC_015554	CCA	2	6	161683	161688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333891621
3021	NC_015554	T	6	6	161722	161727	0 %	100 %	0 %	0 %	333891621
3022	NC_015554	CTA	2	6	161870	161875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891621
3023	NC_015554	A	6	6	161978	161983	100 %	0 %	0 %	0 %	333891621
3024	NC_015554	ATG	2	6	161993	161998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891621
3025	NC_015554	A	6	6	162023	162028	100 %	0 %	0 %	0 %	333891621
3026	NC_015554	A	6	6	162030	162035	100 %	0 %	0 %	0 %	333891621
3027	NC_015554	ATC	2	6	162077	162082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891621
3028	NC_015554	TTA	2	6	162184	162189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015554	TTA	2	6	162213	162218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891622
3030	NC_015554	CTAC	2	8	162301	162308	25 %	25 %	0 %	50 %	333891622
3031	NC_015554	ACCAGT	2	12	162331	162342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333891622
3032	NC_015554	TTG	2	6	162435	162440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891622
3033	NC_015554	CA	3	6	162532	162537	50 %	0 %	0 %	50 %	333891622
3034	NC_015554	AAC	2	6	162603	162608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891622
3035	NC_015554	GC	3	6	162628	162633	0 %	0 %	50 %	50 %	333891622
3036	NC_015554	TTG	2	6	162669	162674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891622
3037	NC_015554	ATG	2	6	162807	162812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891622
3038	NC_015554	ATT	2	6	162821	162826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891622
3039	NC_015554	CCATT	2	10	162843	162852	20 %	40 %	0 %	40 %	333891622
3040	NC_015554	TCTG	2	8	162883	162890	0 %	50 %	25 %	25 %	333891622
3041	NC_015554	CACTGG	2	12	162903	162914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333891622
3042	NC_015554	CTT	2	6	162982	162987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891622
3043	NC_015554	CGT	2	6	162993	162998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891622
3044	NC_015554	GTTA	2	8	163073	163080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015554	TAA	2	6	163160	163165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891623
3046	NC_015554	CTG	2	6	163204	163209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891623
3047	NC_015554	AAT	2	6	163279	163284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891623
3048	NC_015554	TCT	2	6	163304	163309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3049	NC_015554	AACG	2	8	163322	163329	50 %	0 %	25 %	25 %	333891623
3050	NC_015554	TCA	2	6	163343	163348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891623
3051	NC_015554	T	6	6	163357	163362	0 %	100 %	0 %	0 %	333891623
3052	NC_015554	TCA	2	6	163397	163402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891623
3053	NC_015554	GTTC	2	8	163431	163438	0 %	50 %	25 %	25 %	333891623
3054	NC_015554	TGA	2	6	163544	163549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891623
3055	NC_015554	CTT	2	6	163644	163649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3056	NC_015554	ACCA	2	8	163652	163659	50 %	0 %	0 %	50 %	333891623
3057	NC_015554	TCT	2	6	163733	163738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3058	NC_015554	GC	3	6	163747	163752	0 %	0 %	50 %	50 %	333891623
3059	NC_015554	ATTG	2	8	163818	163825	25 %	50 %	25 %	0 %	333891623
3060	NC_015554	GCA	2	6	163884	163889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891623
3061	NC_015554	CTT	3	9	164065	164073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3062	NC_015554	CAA	2	6	164178	164183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891623
3063	NC_015554	TCT	2	6	164253	164258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3064	NC_015554	TAA	2	6	164277	164282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891623
3065	NC_015554	A	6	6	164333	164338	100 %	0 %	0 %	0 %	333891623
3066	NC_015554	AG	3	6	164380	164385	50 %	0 %	50 %	0 %	333891623
3067	NC_015554	TCT	2	6	164393	164398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3068	NC_015554	TGC	2	6	164536	164541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891623
3069	NC_015554	GGAA	2	8	164561	164568	50 %	0 %	50 %	0 %	333891623
3070	NC_015554	TTA	2	6	164660	164665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891623
3071	NC_015554	ACG	2	6	164699	164704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891623
3072	NC_015554	G	6	6	164737	164742	0 %	0 %	100 %	0 %	333891623
3073	NC_015554	AACT	2	8	164743	164750	50 %	25 %	0 %	25 %	333891623
3074	NC_015554	AGT	2	6	164771	164776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891623
3075	NC_015554	GTAT	2	8	164796	164803	25 %	50 %	25 %	0 %	333891623
3076	NC_015554	CT	3	6	164842	164847	0 %	50 %	0 %	50 %	333891623
3077	NC_015554	GGC	2	6	164848	164853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333891623
3078	NC_015554	T	6	6	164862	164867	0 %	100 %	0 %	0 %	333891623
3079	NC_015554	TTC	2	6	164872	164877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3080	NC_015554	AAG	2	6	164906	164911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891623
3081	NC_015554	TTC	2	6	164971	164976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891623
3082	NC_015554	GTCA	2	8	165034	165041	25 %	25 %	25 %	25 %	333891623
3083	NC_015554	AG	3	6	165101	165106	50 %	0 %	50 %	0 %	333891623
3084	NC_015554	AAG	2	6	165199	165204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891623
3085	NC_015554	TTC	2	6	165253	165258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891624
3086	NC_015554	TTC	2	6	165305	165310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891624
3087	NC_015554	CTT	2	6	165327	165332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891624
3088	NC_015554	GAA	2	6	165376	165381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891624
3089	NC_015554	TAA	2	6	165436	165441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891624
3090	NC_015554	GAT	2	6	165469	165474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891624
3091	NC_015554	T	6	6	165583	165588	0 %	100 %	0 %	0 %	333891624
3092	NC_015554	CGA	2	6	165639	165644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891624
3093	NC_015554	T	7	7	165698	165704	0 %	100 %	0 %	0 %	333891624
3094	NC_015554	AGC	2	6	165847	165852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891625
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3096	NC_015554	GTT	2	6	165864	165869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891625
3097	NC_015554	GCT	2	6	165959	165964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891625
3098	NC_015554	AAC	2	6	165985	165990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891625
3099	NC_015554	AGA	2	6	166068	166073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891625
3100	NC_015554	TTC	2	6	166113	166118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891625
3101	NC_015554	CAA	2	6	166139	166144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891625
3102	NC_015554	AAT	2	6	166249	166254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891625
3103	NC_015554	TCA	2	6	166264	166269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891625
3104	NC_015554	TGC	2	6	166296	166301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891625
3105	NC_015554	AAT	2	6	166365	166370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891625
3106	NC_015554	GAT	2	6	166414	166419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891625
3107	NC_015554	GTA	2	6	166436	166441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891625
3108	NC_015554	GGA	2	6	166498	166503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333891625
3109	NC_015554	GTA	2	6	166526	166531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891625
3110	NC_015554	AGC	2	6	166570	166575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891625
3111	NC_015554	AAC	2	6	166590	166595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891625
3112	NC_015554	ACC	2	6	166596	166601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333891625
3113	NC_015554	T	7	7	166610	166616	0 %	100 %	0 %	0 %	333891625
3114	NC_015554	CTTT	2	8	166634	166641	0 %	75 %	0 %	25 %	333891625
3115	NC_015554	GC	3	6	166688	166693	0 %	0 %	50 %	50 %	333891625
3116	NC_015554	TTC	2	6	166740	166745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891625
3117	NC_015554	TGCT	2	8	166749	166756	0 %	50 %	25 %	25 %	333891625
3118	NC_015554	CAA	2	6	166790	166795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891625
3119	NC_015554	CAA	2	6	166910	166915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891625
3120	NC_015554	TGA	2	6	166938	166943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891625
3121	NC_015554	TAC	2	6	166961	166966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891625
3122	NC_015554	GCA	2	6	166991	166996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891625
3123	NC_015554	ATGA	2	8	167013	167020	50 %	25 %	25 %	0 %	333891625
3124	NC_015554	GCT	2	6	167027	167032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891625
3125	NC_015554	TTCT	2	8	167153	167160	0 %	75 %	0 %	25 %	333891625
3126	NC_015554	CTT	2	6	167360	167365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891625
3127	NC_015554	TGG	2	6	167516	167521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891626
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3131	NC_015554	TGAAC	2	10	167834	167843	40 %	20 %	20 %	20 %	333891626
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3134	NC_015554	TCG	2	6	167980	167985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891626
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3136	NC_015554	T	6	6	168189	168194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_015554	TGC	2	6	168212	168217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_015554	AGT	2	6	168253	168258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_015554	TA	3	6	168330	168335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_015554	CTT	2	6	168348	168353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_015554	GCT	2	6	168435	168440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_015554	CT	3	6	168439	168444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3143	NC_015554	ACT	2	6	168475	168480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891627
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3156	NC_015554	GAC	2	6	169177	169182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891627
3157	NC_015554	CGT	2	6	169258	169263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891627
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3162	NC_015554	TCT	2	6	169503	169508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3163	NC_015554	CTAT	2	8	169564	169571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3173	NC_015554	TGTAA	2	10	170131	170140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3202	NC_015554	TTA	2	6	171590	171595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3203	NC_015554	AAGG	2	8	171703	171710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3231	NC_015554	A	7	7	173500	173506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_015554	T	7	7	173521	173527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_015554	T	6	6	173530	173535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_015554	AT	3	6	173612	173617	50 %	50 %	0 %	0 %	333891634
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3239	NC_015554	GGT	2	6	173811	173816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891634
3240	NC_015554	A	6	6	173823	173828	100 %	0 %	0 %	0 %	333891634
3241	NC_015554	ACA	2	6	173873	173878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_015554	TTTA	2	8	173921	173928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_015554	T	6	6	173944	173949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_015554	ACTT	2	8	173983	173990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3245	NC_015554	ATC	2	6	174081	174086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3248	NC_015554	TCT	2	6	174162	174167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3371	NC_015554	GCA	2	6	181971	181976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891640
3372	NC_015554	TCA	2	6	181988	181993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891640
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3374	NC_015554	GC	3	6	182118	182123	0 %	0 %	50 %	50 %	333891640
3375	NC_015554	GGC	2	6	182135	182140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333891640
3376	NC_015554	TCA	2	6	182204	182209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891640
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3386	NC_015554	ATT	3	9	182512	182520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_015554	ATC	2	6	182523	182528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3388	NC_015554	CTG	2	6	182540	182545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3393	NC_015554	CAA	2	6	182778	182783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891641
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3395	NC_015554	T	7	7	182908	182914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3396	NC_015554	TGC	2	6	182956	182961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891642
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3451	NC_015554	TTG	2	6	185983	185988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3455	NC_015554	TCAA	2	8	186073	186080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3461	NC_015554	CTGT	2	8	186317	186324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3463	NC_015554	AAT	2	6	186372	186377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3464	NC_015554	TATT	2	8	186383	186390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3466	NC_015554	T	6	6	186510	186515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3471	NC_015554	GGGTT	2	10	186739	186748	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3475	NC_015554	TCA	2	6	186907	186912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3477	NC_015554	TGG	2	6	187042	187047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3479	NC_015554	GCATC	2	10	187100	187109	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3481	NC_015554	A	6	6	187293	187298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3482	NC_015554	GCG	2	6	187317	187322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3483	NC_015554	TAG	2	6	187332	187337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3485	NC_015554	ATT	2	6	187387	187392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3486	NC_015554	CAT	2	6	187460	187465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3489	NC_015554	AAC	2	6	187558	187563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3490	NC_015554	AAC	2	6	187587	187592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3491	NC_015554	ATA	2	6	187616	187621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_015554	AATT	2	8	187658	187665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_015554	TCAT	2	8	187768	187775	25 %	50 %	0 %	25 %	333891644
3494	NC_015554	TGG	2	6	187909	187914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891644
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3497	NC_015554	CAT	2	6	188138	188143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891644
3498	NC_015554	CAA	2	6	188148	188153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891644
3499	NC_015554	TCA	2	6	188319	188324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891644
3500	NC_015554	TGC	2	6	188366	188371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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